朱耷的画作在东方尤其在日本备受推崇，并在世界画坛引起了很大的反响，如： 

《孔雀竹石图》《孤禽图》《眠鸭图》《猫石杂卉图》，以及《荷塘戏禽图卷》、《河上花并题图卷》、《鱼鸭图卷》、《莲花鱼乐图卷》、《杂花图卷》《杨柳浴禽图轴》、《芙蓉芦雁图轴》、《大石游鱼图轴》、《双鹰图轴》、《古梅图轴》、《墨松图轴》、《秋荷图轴》、《芭蕉竹石图轴》、《椿鹿图轴》、《快雪时晴图轴》、《幽溪泛舟图轴》、《四帧绢本浅绛山水大屏》等，许多条幅，册页中的花鸟鱼鸭，山水树石等。

书法方面有《临兰亭序轴》、《临“临河叙”四屏》，以及各大家法帖和行草诗书轴册等，都在国内外的博物馆、院中珍藏。

朱耷的书画有少小说诗歌文学作品，已不复得见。

近年部分朱耷作品艺术品投资市场拍卖情况： 

《竹石鸳鸯》，2010，西泠印社拍场，成交价1.187亿。

《个山杂画册》，2008，西泠印社拍场，成交价2352万元。

《山青水碧鸟语花香》，2008，佳士得拍场，成交价3426万元。

《鹭石图》，2008，北京万隆拍场，成交价3300万。

《瓶菊图》，2008，中国嘉德拍场，成交价3136万元（不含佣金）。