两者的相同点。都表示在某方面有特长的意思。即在某一方面比较熟悉，能运用自如。都用在动词或动词性短语前面。  谓在某方面擅长。《二刻拍案惊奇》卷十二：“仲友晓得他善於词咏，就将红白桃花为题，命赋小词。”清魏源《圣武记》卷六：“缅人善於操舟。”巴金《利娜》：“他有学问，又善于辞令，很得人欢心。”

两者的不同点。擅于的意思是独具某种特长 ，表示在某一专业方面特别精通。善于含有在某一方面好一点的意思，即在某方面具有特长，并不含有特别精通之意，程度比“擅长”差得多。  善于：（偶而也写作“擅于”）泛指在某一方面具有特长，可以用于某一技能或行动，除了“善于辞令”等习惯用法外，它的宾语不能是名词或名词性短语。  擅于一般只用于某一技能，宾语可以是名词或名词性短语。