滨州医学院于2001年在山东省烟台市建立新校区即烟台校区，现在设有临床医学、口腔医学、护理学、生物技术、中医学（中西医结合方向）、信息管理与信息系统、麻醉学、医学影像学、法学（医事法律方向）、统计学（卫生统计学方向）、英语（医学方向）、药学（临床药学方向）等17个本科专业和方向。

滨州医学院现有滨州、烟台两个校区，占地1589.5亩，总建筑面积62.9万平方米；资产总值12.5亿元，教学科研仪器设备总值2.33亿元。滨州医学院的本科部基本都在烟台，滨州部分主要是附属医院和专科、成教以及见习点。

学校设有14个院（系），有29个本科专业（方向），3个硕士学位授权一级学科，40个硕士学位授权二级学科，5个硕士专业学位授权点。学校全日制在校生16800余人，其中本专科生16300余人、硕士研究生501人，面向全国29个省（市、自治区）招生。