温州大学主要有三个校区，09年小半年还将进一步整合，现有学院路校区，茶山高教园区南校区，茶山高教园区北校区。

学院路校区将陆续搬迁整合到南北两校区。

南校区：美术与设计学院，数学与信息科学学院，机电工程学院，建筑与土木工程学院，物理与电子信息工程学院，独立学院城市学院；

北校区：人文学院，法政学院，音乐学院，体育学院，商学院，教育学院，国际合作学院，外国语学院，独立学院瓯江学院，温州女子学院；

学院路校区：化学与材料工程学院，生命与环境科学学院，教育学院一部分教学点，成人（继续）教育学院。